Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms