Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms