Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED27Q6P2C8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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