Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLX4IPQ5VYV7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms