Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf135Q5VTT2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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C9orf135Q5VTT2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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