Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHSL1Q5SYE7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms