Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FRMPD1Q5SYB0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms