Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHYHD1Q5SRE7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms