Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHC1Q5JVL4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms