Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms