Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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