Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF628Q5EBL2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF628Q5EBL2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms