Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODF2Q5BJF6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms