Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms