Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms