Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms