Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms