Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms