Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBPF1Q3BBV0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF1Q3BBV0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms