Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms