Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms