Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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