Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms