Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
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NCOA1Q15788 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
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