Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP10Q15642 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms