Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTH1Q15438 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms