Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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UBE3CQ15386 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21■□□□□ 0.95
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UBE3CQ15386 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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UBE3CQ15386 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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UBE3CQ15386 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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UBE3CQ15386 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3CQ15386 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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