Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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