Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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