Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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