Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAPTM4AQ15012 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAPTM4AQ15012 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms