Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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