Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms