Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD4Q14839 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms