Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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