Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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