Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

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Length 4,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAT1Q14517 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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FAT1Q14517 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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FAT1Q14517 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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FAT1Q14517 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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FAT1Q14517 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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FAT1Q14517 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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FAT1Q14517 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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FAT1Q14517 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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FAT1Q14517 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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FAT1Q14517 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT1Q14517 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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