Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BECN1Q14457 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BECN1Q14457 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BECN1Q14457 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BECN1Q14457 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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