Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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