Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARF1Q14162 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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