Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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