Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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