Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE7AQ13946 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms