Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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