Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAPSNQ13702 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAPSNQ13702 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms