Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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