Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF5Q13568 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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