Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATRQ13535 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRQ13535 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRQ13535 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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