Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FOXE3Q13461 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FOXE3Q13461 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FOXE3Q13461 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FOXE3Q13461 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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