Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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